برخی از شما ممکن است تعجب کنید که این مخفف Bro5 چیست … Bro5 یا “بفراتر از rاول of 5“، به معنای نمایش بخش وسیعی از فضای شیمی است که به شدت توسط مولکول هایی پر شده است که به عنوان دارو عمل می کنند، اما به اصطلاح قانون لیپینسکی 5 را برای خواص مشابه دارو برآورده نمی کنند. در اینجا دستورات معروف لیپینسکی آمده است:

همانطور که معمولاً اتفاق می افتد، استثناها این قاعده را ثابت می کنند. لازم نیست خیلی دور برویم: مورد تاکسول را در نظر بگیرید. این شاخص کاملاً زیستی در دسترس است، اما برخی از قوانین Lipinski را نقض می کند. مشخصه دوره پس از لیپینسکی، تلاش برای منطقی کردن رفتار سایر عوامل پرت که از کمپین های کشف مواد مخدر به وجود آمده اند، است. مهمتر از آن، آیا می‌توانیم مولکول‌های نسبتاً بزرگ با فراهمی زیستی خوراکی مطلوب را پیش‌بینی کنیم؟ وقتی نوبت به تحقیقات آزمایشگاه من می‌رسد، ملاحظات Bro5 نزدیک به خانه‌شان می‌شود، زیرا ماکروسیکل‌های پپتیدی جزو اهداف مورد علاقه ما هستند. مقاله زیر که چندین سال پیش توسط تیمی از Pfizer در بریتانیا منتشر شد، حاوی بحث بسیار خوبی در مورد Bro5 است. این دست‌نوشته همچنین ثابت می‌کند که طراحی منطقی پپتیدهای حلقوی زیست‌دسترس خوراکی باید امکان‌پذیر باشد. همانطور که در پست‌های قدیمی‌تر من دیده‌اید، تشکیل پیوندهای هیدروژنی درون مولکولی عامل اصلی فراهمی زیستی خوراکی پپتیدهای حلقوی است. این فعل و انفعالات ضعیف به طور مشترک گروه های عملکردی قطبی را محافظت می کنند و نفوذپذیری غشاء و جذب روده را تسهیل می کنند. یک سوال وسوسه‌انگیز این است که آیا می‌توان پیش‌بینی‌های ساده پیوندهای هیدروژنی درون مولکولی را از طریق مدل‌سازی ساختارهای ماکروسیکل فاز گاز کم‌انرژی انجام داد یا خیر. من همیشه فکر می‌کردم که برخی از ترکیبات تاخورده پپتیدهای حلقوی ممکن است با استفاده از چنین ابزارهای ساده کاملاً قابل پیش‌بینی باشند. کار Pfizer در MedChemComm از این مفهوم پشتیبانی می کند. پس… چرا با زحمت زیاد ماکروسکل ها بسازید و آنها را غربال کنید؟ بیا فقط یکی بسازیم عزیزم…