فرض کنید یک آنزیم دارید. این یک سایت فعال، یک بستر شناخته شده، و آن همه جاز دارد. اگر سنجش فعالیت این آنزیم را می‌دانید، می‌توانید آزمایش‌هایی را با هدف بازدارنده‌ها با اندازه‌گیری گردش سوبسترا طراحی کنید. در حالی که ابزارهای زیادی برای هدف قرار دادن بازدارنده‌های سایت فعال رقابتی (هم کووالانسی و هم غیرکووالانسی) وجود دارد، وضعیت برای به اصطلاح بسیار بدتر است. آلوستریک مهار کننده ها اینها در یک لیگ خاص خود هستند زیرا به جایی غیر از سایت فعال متصل می شوند. شناسایی مکان‌های آلوستریک و طراحی مهارکننده‌هایی که به آنجا متصل می‌شوند، کار جالبی است. اوایل امروز در یک سخنرانی در دانشگاه تورنتو توسط ولفگانگ جانکه از نوارتیس، سوئیس شرکت کردم. خلاصه یکی از پروژه های او در شرح داده شده است JACS مقاله ای که می خواهم امشب در مورد آن صحبت کنم. در آن، جانکه و همکارانش محل آلوستریک Bcr-Abl کیناز را مورد بررسی قرار دادند. اسید میریستیک لیگاند طبیعی این سایت است (به زیر مراجعه کنید – من این تصاویر را با استفاده از PyMol ساخته ام). همانطور که معلوم است، دو انطباق ممکن وجود دارد. هنگامی که اسید میریستیک متصل می شود، یکی از مارپیچ ها خم می شود (نشان داده می شود). بدون اسید میریستیک، مارپیچ بدون ساختار است. نویسندگان یک سنجش هوشمندانه NMR طراحی کردند: آنها ابتدا کیناز برچسب گذاری شده با 15N را در Val525 تهیه کردند (به رنگ صورتی “V” در زیر مولکول اسید میریستیک مراجعه کنید؟). هنگامی که اسید میریستیک به آنزیم متصل می شود، Val525 ساختار یافته است و سیگنال ضعیفی در طیف 15N/1H HSQC می دهد، در حالی که حالت غیر متصل با سیگنال Val525 قوی مشخص می شود. با در دست داشتن این موضوع، تیم Novartis سنجشی را توسعه دادند که در آن ابتدا یک بازدارنده شناخته شده را اضافه کردند (PD166326 یکی از آنها بود که در نمودار زیر به عنوان “مهار کننده” شناخته شده است). نقش این مولکول اتصال به روش متعارف (در محل ATP) و تثبیت ساختار کیناز غیرفعال است. متعاقبا، نویسندگان قطعات کوچک مولکول را غربال کردند و پیک Val525 HSQC را زیر نظر گرفتند. “Hit” ها مولکول هایی بودند که سیگنال Val را ضعیف می کردند. این یک آزمایش زیبا است که نویسندگان را قادر می سازد تا قطعاتی را کشف کنند که در هماهنگی با PD166326 عمل می کنند (یکی از آنها در سمت راست گرافیک زیر نشان داده شده است). با توجه به این واقعیت که جهش نقطه ای مکانیسم اصلی مقاومت در برابر مهارکننده های کیناز رقابتی ATP است، می توانید مزایای این روش را برای غلبه بر مقاومت در برابر مهار کننده های فعلی Bcr-Abl مشاهده کنید. مصرف کوکتل ها در کنسرت ممکن است یک رویکرد درمانی قانع کننده برای مبارزه با سرطان باشد. من عاشق علوم بنیادی بودم که در اینجا به توسعه سنجش پرداخته است. اتفاقاً یکی از این ترکیب ها ظاهراً هفته آینده وارد فاز دوم می شود. موفق باشید، Novartis!